藏在山东疾控实验室里的是新冠病毒的密码,全基因组测序技术能让病毒没地方可藏,从而为疫情防控提供精准的科学依据,这项技术的应用恰恰是山东能在全国率先找到“物传人”证据链的关键之处。
离病毒最近的地方
全省新冠病毒检测的核心阵地是省疾控当中的那个实验室,各市首例病例的复核属于这里,病毒毒株的分离是在这里进行的,全基因测序是在这里完成的,溯源分析也是在这里做的,所有关键环节都在此搞定,全省15市的那个阳性样本首诊复核这一情况,是依靠这个实验室才确定的。
在2020年疫情刚开始的时候,实验室肩负着各市首个案例以及疑难病症案例的检测复核使命。检测的人员划分成三组,全天24小时随时准备着,保证样本一旦到达就能立即进行检测。无论在什么时候收到样本,他们都必须马上动手,在极短的时间之内开启工作,为疫情的防控去争取非常珍贵的时间。
全基因测序怎么让病毒现形
病毒性传染病防制所有一位负责主管技术方面事务的技师,名叫姚明晓,他介绍说,全基因组测序,换言之,就是去读出病毒的碱基序列,这一行为如同给病毒拍摄了一张 “全身照”,借助与数据库里的其他序列进行比对,如此一来,便能够分析出病毒跟哪里的毒株存在同源关系,以及病毒是否发生了变异。
这项技术对于样本的要求是极严格且相当高的,对于此姜晓林提到,这个病毒性传染病防制所的副所长表示,标本应当保持新鲜的状态,病毒量必须要足够充足,操作务必要合规规范。环境当中所存在着的一些物质能够让病毒核酸发生降解,为了能够保证测序结果的准确性,实验室在每次收到阳性样本的时候,都需要立刻展开相关工作,绝对不能出现哪怕毫厘般的耽搁,都不能延迟。
找到物传人的铁证
在2020年9月的时候,青岛港大港公司有2例无症状感染者被发现,省疾控中心借助全基因组测序,判定无症状感染者样本跟进口冷冻水产品的病毒阳性样本基因序列在高度上是同源的,这样的发现给流行病学调查指出了方向。
专家根据流行病调查的结果进行研判,得出两名无症状感染者属于早期感染的结论,其感染途径和受到污染的进口冷冻水产品存在关联。这在世界范围内首次发现了充分的证据链,此证据链显示新冠病毒能够通过物品传播给人,而且在冷冻状态下可以长时间存活。鉴于这样的判断,山东迅速对冷链相关的防控措施作出调整并加以完善。
分离出山东首株毒株
另一项重要工作是省疾控中心实验室进行新冠病毒毒株分离。省疾控中心拥有生物安全三级实验室,这是全省唯一,其构成了硬件保障,满足毒株分离需求。病毒性传染病防制所刘倜介绍了该情况,操作难度大、耗费时间长系指对毒株分离而言有所述两个特点。
在2020年2月19日这天,实验室成功分离出了山东省首株新型冠状病毒毒株,这一成果为后续的疫苗研发提供了基础材料,为药物筛选提供了基础材料,也为检测试剂改进提供了基础材料。而毒株的成功分离,同样标志着山东在新冠病毒研究领域跨出了关键一步。
全省检测网这样织起来
省疾控中心于配置二代测序仪并具全基因组测序能力当之时,大力去推动各式市、县实验室能力建设。各基层单位逐而陆续配置仪器,且选配专业技术人才,其检测能力逐而渐渐提升。
省疾控中心引领开展市县两级实验室工作人员理论培训,还开展操作技能培训,并且组织了多次质量控制考核。凭借持续的能力建设举措,全省构建起一张敏感可靠的检测监控网络,此网络为病例早期发现奠定了基础,也为疫情防控关口前移奠定了基础。
变异株逃不过火眼金睛
现状中,海外新冠病毒持续不断变异着,在此情形下,实验室检测的重要性愈发突显出来,今年1月4日,省疾控中心完成了对青岛报告的1例英国输入病例样本的全基因测序分析,经过比对,其与近期备受高度关注的英国变异株序列呈现出高度同源的情况。
省疾控中心,突发公共卫生事件处置领域的首席专家雷杰觉得,借助实验室之检测工作来发觉变异株,表明于疫情防控常态化的情形下,我们具备那种借由强有力的监测,及时去发现病毒变异株的能力,能够及时开展相关研究,也能及时完善应对举措,证实此监测体系乃是敏感且可靠的。
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